dr inż. Marek Orłowski

Email: marek.orlowski@pwr.edu.pl

---

Jednostka: Wydział Chemiczny » Katedra Biochemii, Biologii Molekularnej i Biotechnologii

---

ul. Gdańska 7/9, Wrocław
bud. F-4, pok. C-14 
tel. 71 320 6286

Konsultacje

• poniedziałek 13.15-15.15
• wtorek 13.15-15.15

Zainteresowania naukowe

• Nadrodzina receptorów jądrowych; funkcjonalny receptor ekdysteroidowy; receptor 20-hydroksyekdyzonu (EcR); białko Ultraspiracle (Usp); przekazywanie sygnałów w komórce; czynniki transkrypcyjne; białka o inherentnie nieuporządkowanej strukturze (IDPs); regiony w białkach o nieuporządkowanej strukturze (IDRs); badania odziaływań białko - białko, białko - DNA; nadekspresja rekombinowanych białek w układach natywnych i heterologicznych; oczyszczanie nadekspresjonowanych rekombinowanych białek z ekstraktów komórkowych (system AKTA do chromatografii, chromatografia powinowactwa, chromatografia żelowa i inne); analizy biochemiczne i strukturalne białek z wykorzystaniem dichroizmu kołowego (CD) i narzędzi bioinformatycznych; badanie zmian konformacyjnych białek; analizy wewnątrzkomórkowej dystrybucji białek z wykorzystaniem różnych eukariotycznych linii komórkowych; analizy sygnałów w białkach warunkujących wewnątrzkomórkową dystrybucję białek: sygnały lokalizacji jądrowej (NLSs), sygnały eksportu z jądra (NESs) i sygnały lokalizacji jąderkowej (NoLS); mikroskopia fluorescencyjna i konfokalna.

Najważniejsze publikacje z ostatnich lat

2018

• Orłowski M., Popławska K., Pieprzyk J., Szczygieł-Sommer A., Więch A., Zarębski M., Tarczewska A., Dobrucki J. & Ożyhar A. 2018, Molecular determinants of Drosophila immunophilin FKBP39 nuclear localization, Biological Chemistry, DOI: https://doi.org/10.1515/hsz-2017-0251.

2017

• Kozłowska M., Tarczewska A., Jakób M., Bystranowska D., Taube M., Kozak M., Czarnocki-Cieciura M., Dziembowski A., Orłowski M., Tkocz K. & Ożyhar, A. 2017, Nucleoplasmin-like domain of FKBP39 from Drosophila melanogaster forms a tetramer with partly disordered tentacle-like C-terminal segments, Scientific Reports, vol. 7, pp. 40405.

2014

• Pieprzyk J., Zbela A., Jakób M., Ożyhar A. & Orłowski M. 2014, Homodimerization propensity of the intrinsically disordered N-terminal domain of Ultraspiracle from Aedes aegypti, Biochimica et Biophysica Acta, vol. 1844, no. 6, pp. 1153-1166.

2007

• Jakób M., Kołodziejczyk R., Orłowski M., Krzywda S., Kowalska A., Dutko-Gwóźdź J., Gwóźdź T., Kochman M., Jaskólski M. & Ożyhar A. 2007, Novel DNA-binding element within the C-terminal extension of the nuclear receptor DNA-binding domain, Nucleic Acids Research, vol. 35, no. 8, pp. 2705-2718.

2004

• Orłowski M., Szyszka M., Kowalska A., Grad I., Zoglowek A., Rymarczyk G., Dobryszycki P., Krowarsch D., Rastinejad F., Kochman M. & Ożyhar A. 2004, Plasticity of the ecdysone receptor DNA binding domain, Molecular Endocrinology, vol. 18, no. 9, pp. 2166-2184.

Publikacje w bazie DONA

Wybrane publikacje
1	Artykuł 2025 Niina Veitonmäki, Anna Kostyn, Sonia Kołt Aleksandra Ziemblicka, Beata Romanowska, Sabina Oleksy, Ewelina Krzywińska, Kamila Sołtys, Łukasz Świderski, Piotr Naporowski, Piotr Mamczur, Monika Świtoń, Marek Orłowski Ying Zhang, Jianming Xu, Anna Andrzejczak, Aleksandra Bielawska-Pohl, Lidia Karabon, Dariusz Wołowiec, Wondossen Sime, Ramin Massoumi, Sameer Deshmukh, Jakub Kołodziejski, Tomasz Klaus, Pieter Spee, A novel fully human anti-ROR1 antibody PBA-0405 optimized for ADCC, induces potent anti-tumor activity against both solid and hematological malignancies. Frontiers in Immunology. 2025, vol. 16, art. 1711509, s. 1-14. ISSN: 1664-3224 Zasoby:DOIURLSFX
2	Artykuł 2024 Dawid Chomicz, Jarosław Kończak, Sonia Wróbel, Tadeusz Satława, Paweł Dudzic Bartosz Janusz, Mateusz Tarkowski, Piotr Deszyński, Tomasz Gawłowski, Anna Kostyn, Marek Orłowski Tomasz Klaus, Lukas Schulte, Kyle Martin, Stephen R Comeau, Konrad Krawczyk, Benchmarking antibody clustering methods using sequence, structural, and machine learning similarity measures for antibody discovery applications. Frontiers in Molecular Biosciences. 2024, vol. 11, s. 1-14. ISSN: 2296-889X Zasoby:DOIURLSFX
3	Artykuł 2024 Tadeusz Satława, Mateusz Tarkowski, Sonia Wróbel, Paweł Dudzic Tomasz Gawłowski, Tomasz Klaus, Marek Orłowski Anna Kostyn, Sandeep Kumar, Andrew Buchanan, Konrad Krawczyk, LAP: liability antibody profiler by sequence & structural mapping of natural and therapeutic antibodies. PLoS Computational Biology. 2024, vol. 20, nr 3, art. e1011881, s. 1-20. ISSN: 1553-734X; 1553-7358 Zasoby:DOIURLSFX
4	Zgłoszenie patentowe opublikowane 2024 Sameer Deshmukh, Monika Litwin, Marek Orłowski Pieter Spee, Damian Trojanowski, Sameer Deshmukh*, Monika Litwin*, Marek Orłowski*, Pieter Spee*, Damian Trojanowski* Zgłoszenie patentowe opublikowane. World Intellectual Property Organization, nr WO 2024/251839, opubl. 12.12.2014. Zgłosz. nr 065505 z 05.06.2024. Anti GARP antibodies and method of use / Sameer Deshmukh [i in.]. 53 s. Zasoby:URL
5	Artykuł 2022 Marta K Kolonko-Adamska Marek Orłowski Beata Greb-Markiewicz Rola kluczowych hormonów i ich receptorów w rozwoju owadów na przykładzie Drosophila melanogaster i Aedes aegypti = Role of key hormones and their receptors in insects development, on the example of Drosophila melanogaster and Aedes aegypti. Kosmos. 2022, vol. 72, nr 3, s. 225-242. ISSN: 0023-4249; 2658-1132 Zasoby:DOIURLSFX
6	Artykuł 2021 Anna J Więch-Walów, Aneta M Tarczewska Andrzej Ożyhar Marek Orłowski Metal ions induce liquid condensate formation by the F domain of Aedes aegypti ecdysteroid receptor. New perspectives of nuclear receptor studies. Cells. 2021, vol. 10, nr 3, art. 571, s. 1-14. ISSN: 2073-4409 Zasoby:DOISFX
7	Artykuł 2020 Aneta M Tarczewska Krzysztof Wycisk, Marek Orłowski Agnieszka Waligórska, Jerzy Dobrucki, Magda Drewniak-Świtalska Łukasz Berlicki Andrzej Ożyhar Nuclear immunophilin FKBP39 from Drosophila melanogaster drives spontaneous liquid-liquid phase separation. International Journal of Biological Macromolecules. 2020, vol. 163, s. 108-119. ISSN: 0141-8130; 1879-0003 Zasoby:DOISFX
8	Artykuł 2019 Magdalena Rowińska-Żyrek, Anna J Więch-Walów, Joanna Wątły, Robert Wieczorek, Danuta Witkowska, Andrzej Ożyhar Marek Orłowski Copper(II)-binding induces a unique polyproline type II helical structure within the ion-binding segment in the intrinsically disordered F-domain of ecdysteroid receptor from Aedes aegypti. Inorganic Chemistry. 2019, vol. 58, nr 17, s. 11782-11792. ISSN: 0020-1669; 1520-510X Zasoby:DOIURLSFX
9	Artykuł 2019 Anna J Więch-Walów, Magdalena Rowińska-Żyrek, Joanna Wątły, Aleksandra Czarnota, Rafał Hołubowicz Zbigniew Szewczuk, Andrzej Ożyhar Marek Orłowski The intrinsically disordered C-terminal f domain of the ecdysteroid receptor from Aedes aegypti exhibits metal ion-binding ability. Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 2019, vol. 186, s. 42-55. ISSN: 0960-0760 Zasoby:DOISFX
10	Artykuł 2018 Kinga Chrzanowska, Anna J Więch-Walów, Marek Orłowski Overexpression of the recombinant 20-hydroxyecdysone receptor (EcR) from Aedes aegypti = Nadekspresja rekombinowanego receptora 20-hydroksyekdyzonu (EcR) z Aedes aegypti. Prace Naukowe Wydziału Chemicznego Politechniki Wrocławskiej. Prace Badawcze Studentów. 2018, z. 16, s. 13-21. ISSN: 1733-0505
11	Artykuł 2018 Krzysztof Wycisk, Aneta M Tarczewska Magdalena Kaus-Drobek, Michał Dadlez, Rafał Hołubowicz Zbigniew Pietras, Andrzej Dziembowski, Michał Taube, Maciej Kozak, Marek Orłowski Andrzej Ożyhar Intrinsically disordered N-terminal domain of the Helicoverpa armigera Ultraspiracle stabilizes the dimeric form via a scorpion-like structure. Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 2018, vol. 183, s. 167-183. ISSN: 0960-0760 Zasoby:DOIURLSFX

Wszystkie publikacje pracownika